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科技服務(wù)

SCIENCE AND TECHNOLOGY SERVICE

細(xì)菌基因組組裝

產(chǎn)品簡(jiǎn)介

細(xì)菌基因組一般較小,約10M以?xún)?nèi),可采用三代測(cè)序技術(shù),對(duì)細(xì)菌基因組進(jìn)行測(cè)序、拼接、組裝,獲得完整細(xì)菌基因信息,細(xì)菌基因組研究不僅有利于研究細(xì)菌的基本生命過(guò)程, 同時(shí)也對(duì)高等真核生物的基因組學(xué)及后基因組學(xué)研究提供了參考。
研究?jī)?nèi)容

1) 數(shù)據(jù)質(zhì)控
2) 基因組初步組裝
3) 基因組情況評(píng)估
4) 基因組組分分析
    編碼基因預(yù)測(cè);重復(fù)序列注釋?zhuān)环蔷幋aRNA預(yù)測(cè);假基因分析;細(xì)菌基因島預(yù)測(cè);前噬菌體預(yù)測(cè);CRISPR序列預(yù)測(cè);
5) 基因組圈圖
6) 基因功能注釋
    通用數(shù)據(jù)庫(kù)注釋?zhuān)篏O, KEGG, COG, Swiss-prot, Nr, KOG, pfam;
7) 比較基因組學(xué)分析

結(jié)果展示


送樣建議

1) 菌體送樣:收集生長(zhǎng)對(duì)數(shù)期菌體,收集離心菌體數(shù)3×10*10 個(gè),無(wú)菌離心管,液氮速凍,干冰運(yùn)輸。

2) DNA濃度 ≥20ng/μl(Qubit),DNA質(zhì)量≥15ug(Qubit)DNA電泳條帶單一,無(wú)明顯降解。

010-80543251

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