產品簡介

宏基因組是指特定環(huán)境中全部微生物遺傳物質的總和，宏基因組測序以特定環(huán)境中全部微生物群落作為研究的對象，提取環(huán)境微生物總DNA進行測序及分析；宏基因組擺脫了傳統(tǒng)微生物研究中分離培養(yǎng)的技術限制，在基因組水平解讀微生物群體的多樣性和豐度，探索微生物與環(huán)境及宿主之間的關系。
研究內容

1) 數(shù)據(jù)質控
2) 基因組組裝及基因預測
3) 物種注釋
   各分類水平上物種豐度圖；Alpha多樣性分析；樣品間差異組成PCA分析；
4) 基因組分預測
   基因預測；轉座元件預測；前噬菌體預測
5) 基因功能注釋
   基因家族分類；通用數(shù)據(jù)庫注釋：GO, KEGG, COG, Swiss-prot, Nr, KOG, pfam；專用數(shù)據(jù)庫注釋；
6) 多樣品比較分析
   篩選與樣品分組顯著相關因子（基因、功能）；基于篩選因子對樣品進行主成分分析（PCA）；基于篩選因子對樣品進行  聚類分析。
結果展示

送樣建議

1、一般以土壤、水體、腸道、根際等微生物為研究對象；
2、樣品選取需要以時間、地域、深度、部位等為參考，建議每個樣品設置3個以上生物學重復；
3、DNA要求：總量≥150ng，濃度≥50ng/μl，OD260/280：1.8-2.0，電泳要求：主帶清晰，無降解或輕度降解；
4、組織樣要求：土壤、根系等固體樣本約1-3g；菌液樣本需離心取沉淀物，不少于50mg；